Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ddb2Q99J79 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ddb2Q99J79 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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