Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Def8Q99J78 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms