Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Apobec3Q99J72 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Apobec3Q99J72 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms