Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ttc30a1Q99J38 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms