Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Smim11aQ99J19 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Smim11aQ99J19 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Smim11aQ99J19 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Smim11aQ99J19 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smim11aQ99J19 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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