Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Cldn16Q925N4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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