Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bbox1Q924Y0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbox1Q924Y0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms