Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lmo1Q924W9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms