Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tgs1Q923W1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgs1Q923W1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms