Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Csmd1Q923L3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Csmd1Q923L3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms