Protein–RNA interactions for Protein: Q922L6

Nelfcd, Negative elongation factor D, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfcdQ922L6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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NelfcdQ922L6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NelfcdQ922L6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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