Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TardbpQ921F2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms