Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Afg3l1Q920A7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Afg3l1Q920A7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Afg3l1Q920A7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Afg3l1Q920A7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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