Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rpe65Q91ZQ5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rpe65Q91ZQ5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rpe65Q91ZQ5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rpe65Q91ZQ5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpe65Q91ZQ5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpe65Q91ZQ5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rpe65Q91ZQ5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpe65Q91ZQ5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpe65Q91ZQ5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rpe65Q91ZQ5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpe65Q91ZQ5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rpe65Q91ZQ5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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