Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Snx11Q91WL6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx11Q91WL6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snx11Q91WL6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms