Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Setd3Q91WC0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Setd3Q91WC0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms