Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdac11Q91WA3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms