Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csde1Q91W50 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csde1Q91W50 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms