Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NifkQ91VE6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms