Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Capn8Q91VA3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn8Q91VA3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms