Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cabp4Q8VHC5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cabp4Q8VHC5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms