Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smg8Q8VE18 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Smg8Q8VE18 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Smg8Q8VE18 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms