Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Apol9aQ8VDU3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms