Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8VDP2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q8VDP2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q8VDP2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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