Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fam20bQ8VCS3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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