Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ubxn4Q8VCH8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn4Q8VCH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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