Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Rapgef3Q8VCC8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rapgef3Q8VCC8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Rapgef3Q8VCC8 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Rapgef3Q8VCC8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms