Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc12Q8R344 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc12Q8R344 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms