Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4S1

Plce1, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase epsilon-1, mousemouse

Predictions only

Length 2,282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plce1Q8K4S1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Plce1Q8K4S1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Plce1Q8K4S1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Plce1Q8K4S1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Plce1Q8K4S1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Plce1Q8K4S1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Plce1Q8K4S1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Plce1Q8K4S1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Plce1Q8K4S1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms