Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hecw1Q8K4P8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hecw1Q8K4P8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms