Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Casc3Q8K3W3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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