Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vmn1r72Q8K3N7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmn1r72Q8K3N7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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