Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r188Q8K3N2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r188Q8K3N2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms