Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

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Length 813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp45Q8K387 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp45Q8K387 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms