Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Lrrtm1Q8K377 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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