Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssh3Q8K330 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms