Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccm2Q8K2Y9 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccm2Q8K2Y9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms