Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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Trappc12Q8K2L8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trappc12Q8K2L8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trappc12Q8K2L8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trappc12Q8K2L8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trappc12Q8K2L8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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Trappc12Q8K2L8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trappc12Q8K2L8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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