Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2K6

Agfg1, Arf-GAP domain and FG repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Agfg1Q8K2K6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Agfg1Q8K2K6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Agfg1Q8K2K6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms