Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Abcf3Q8K268 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Abcf3Q8K268 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Abcf3Q8K268 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf3Q8K268 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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