Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prkd3Q8K1Y2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prkd3Q8K1Y2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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