Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S1

Lgi4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi4Q8K1S1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lgi4Q8K1S1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lgi4Q8K1S1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms