Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nek9Q8K1R7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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