Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn34c1Q8K193 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn34c1Q8K193 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Cldn34c1Q8K193 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn34c1Q8K193 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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