Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc47a1Q8K0H1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms