Protein–RNA interactions for Protein: Q8K083

Znf536, Zinc finger protein 536, mousemouse

Predictions only

Length 1,302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Znf536Q8K083 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Znf536Q8K083 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf536Q8K083 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Znf536Q8K083 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Znf536Q8K083 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf536Q8K083 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms