Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pkn3Q8K045 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkn3Q8K045 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms