Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
SbsnQ8CIT9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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