Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Card11Q8CIS0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Card11Q8CIS0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Card11Q8CIS0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms