Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cog3Q8CI04 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cog3Q8CI04 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms